1) Открываем Nautilus (файловый менеджер)
2) Ищем наш браузер по адресу /usr/share/applications/
3) Кликаем правой кнопкой мыши и выбираем "Свойства"
4) В строку "Команда" пишем необходимые параметры:
--proxy-server="foopy:8080" - адрес и порт вашего прокси
--proxy-bypass-list="*.google.com;*foo.com;127.0.0.1:8080" - здесь можно перечислить сайты которые вы хотите добавить в исключения прокси
5) Закрываем. Готово.
Для более подробной информации читайте официальную документацию Хромиума.